Práve bol publikovaný neuveriteľný dokument

(vďaka Davidovi Wisemanovi za upozornenie)

Jessica Rose, 18. júna 2022

Je to neuveriteľné strašným spôsobom.

Prečítajte si, prosím, tento článok s názvom: "Neurotoxické amyloidogénne peptidy v proteóme SARS-COV2: potenciálne dôsledky pre neurologické príznaky v COVID-19". Bol uverejnený v časopise Nature Communications 13. júna 2022. (1)

Podstatou tejto neuveriteľnej práce je, že v otvorených čítacích rámcoch* (ORF) 6 a 10 z vírusu SARS-nCoV-2 sa nachádzajú dva amyloidogénne proteíny (ten v ORF-10 nemá homológ v SARS-nCoV – to znamená, že je jedinečný pre SARS-nCoV-2), ktoré tvoria kryštalické amyloidné štruktúry nezávisle, spolu, pri izbovej teplote (!) veľmi rýchlo, a že tieto štruktúry vyvolávajú programovanú bunkovú smrť v nervových bunkách.

Predtým, ako rozbalím tento článok, chcem niečo povedať. Myslím si, že tento článok mohol byť uverejnený v tomto prestížnom časopise z dvoch dôvodov: 1. ide o COVID-19 (SARS-nCoV-2) a 2. ide o ORF a NIE o amyloidogénne peptidy zo spike proteínu. Skôr ako začnem, tu je genóm SARS-nCoV-2 a niekoľko informácií o ORF-6 (2,3,4), ktorý je sám o sebe vysoko patogénnym proteínom (5).

Modelovanie genómu SARS-COV-2 pomocou programu I-TASSER. zhanglab.dcmb.med.umich.edu

Začnime. Títo úžasní ľudia urobili rovnakú vec, aká je opísaná v tomto dokumente (A), ktorý som tu opísala (B). Aby som to stručne zhrnula, použili algoritmy na predpovedanie amyloidov (TANGO) a iné bioinformatické nástroje (ZIPPER), ktoré poskytli výber okien rezíduí špecifických dĺžok. Našli 2 uchádzačské amyloidogénne peptidy, ktoré sa nachádzajú v ORF 6 a 10 SARS-nCoV-2: ILLIIM a RNYIAQVD. Práve tieto dva sa rozhodli syntetizovať a študovať kvôli ich predpokladanému amyloidogenetickému potenciálu.

Algoritmy na predpovedanie agregácie amyloidov identifikovali dva krátke peptidy z ORF6 a ORF10, ktoré pravdepodobne tvoria amyloidy.

Moji čitatelia už veľmi dobre vedia, že amyloidné proteíny sú naozaj bohaté na beta-listy (C). Nižšie je uvedený obr. 1 z článku, ktorý ukazuje, kde sa peptidy nachádzajú v príslušných ORF (ORF-6 a ORF-10) a ich sklony k tvorbe beta listov.

Zobrazenie v nanorozmeroch odhaľuje, že obe peptidové sekvencie sa samy zostavujú do polymorfných amyloidných zostáv.

Na podmienkach, za ktorých sa štruktúry zostavili, ma zaujali dve veci: k zostaveniu došlo pri izbovej teplote a došlo k nemu okamžite.

Zobrazovanie oboch peptidových zostáv pomocou mikroskopie atómových síl (AFM) odhalilo, že oba peptidy sa pri teplote 37 °C takmer okamžite zostavili pri koncentrácii 1 mg ml-1 (doplnkové obrázky 1 a 2) do vysoko polymorfnej zmesi nanovláknitých a kryštalických štruktúr.

Nie sú tie obrázky neuveriteľné! Ihličkovité štruktúry, ktoré každý peptid vytvoril nezávisle, sa mierne líšili tým, že:

ILLIIM má tendenciu vytvárať veľmi veľké (2–3 μm široké) viacvrstvové kryštalické zostavy (obr. 2g), zatiaľ čo RNYIAQVD vytvára prevažne dlhé lineárne ihlicovité štruktúry.

Ďalšia vec, ktorá ma zaujala na tom, čo zistili, je, že tieto peptidy, ktoré sa zhromažďujú do týchto štruktúr, "majú tendenciu ukladať sa na seba a vytvárať viacvrstvové štruktúry".

Autori použili najrôznejšie techniky, ako napríklad "rozptyl röntgenového žiarenia, spektroskopickú charakterizáciu, fluorescenčnú mikroskopiu a molekulárne modelovanie, ktoré potvrdzujú amyloidnú povahu zostáv".

Vo svetle týchto neuveriteľných zistení sa ešte stále nemusí prejaviť účinok in vivo alebo v živých organizmoch, ako je človek. Predpokladali toxicitu pre ľudské neuróny a túto hypotézu skúmali pomocou ľudskej bunkovej línie SH-SY5Y vystavenej ILLIIM aj RNYIAQVD. Zistili, že ILLIIM a RNYIAQVD vyvolali v bunkách neskoré štádium apoptózy (programovanú bunkovú smrť), pričom ILLIIM tak urobil výrazne vo veľmi nízkych koncentráciách (0,04 mg ml-1 oproti 0,15 mg ml-1 pre ILLIIM a RNYIAQVD v uvedenom poradí.

Zhrnutie: Dva peptidy z ORF-6 a ORF-10 SARS-nCoV-2 vyvolávajú apoptózu v ľudských nervových bunkách.

Následne dospeli k záveru, že práve to spôsobuje všetky neurologické problémy spojené s COVID-19.

Cytotoxicita a štruktúra týchto zostáv odolná voči proteázam môže mať za následok ich pretrvávajúcu prítomnosť v CNS pacientov po infekcii, ktorá by mohla čiastočne vysvetliť pretrvávajúce neurologické príznaky COVID-19.

Viem, čo si myslíte. Položme si teda tri otázky nášho života?

Otázka 1: Nachádzajú sa amyloidogénne peptidy v proteíne hrotu SARS-nCoV-2 a sú schopné vyvolať apoptózu v nervových bunkách a/alebo iných typoch buniek?

Otázka 2: Keďže modifikované spike proteíny, ktoré sa používajú na konštrukciu užitočného zaťaženia s LNP v injekčných biologických produktoch Moderna a Pfizer, sú odvodené od spike SARS-nCoV-2, prenášajú sa tieto navrhované amyloidogénne vlastnosti?

Otázka 3: Ak modifikovaný spike proteín v injekčných produktoch COVID-19 obsahuje amyloidogénne peptidy schopné zostavovať sa do amyloidných štruktúr, je to dôvod, prečo pozorujeme také systémové neurologické, hepatologické, kardiovaskulárne a reprodukčné poškodenia v súvislosti s hláseniami o nežiaducich udalostiach v databázach ako VAERS, Eudra a Yellowcard?

preklad: Kishino Katana —> https://tinyurl.com/yxxk3y9a

1 Charnley, M., Islam, S., Bindra, G.K. et al. Neurotoxic amyloidogenic peptides in the proteome of SARS-COV2: potential implications for neurological symptoms in COVID-19. Nat Commun 13, 3387 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-30932-1.

2 Baric Ralph A. et al., Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Open Reading Frame (ORF) 3b, ORF 6, and Nucleocapsid Proteins Function as Interferon Antagonists. Journal of Virology. 2007. Vol. 81, No.2 https://journals.asm.org/doi/10.1128/jvi.01782-06?permanently=true.

3 Lei, X., Dong, X., Ma, R. et al. Activation and evasion of type I interferon responses by SARS-CoV-2. Nat Commun 11, 3810 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-17665-9.

4 Lee, JG., Huang, W., Lee, H. et al. Characterization of SARS-CoV-2 proteins reveals Orf6 pathogenicity, subcellular localization, host interactions and attenuation by Selinexor. Cell Biosci 11, 58 (2021). https://doi.org/10.1186/s13578-021-00568-7.

5 Nasim Kheshtchin, Parisa Bakhshi, Samaneh Arab, Maryam Nourizadeh, Immunoediting in SARS-CoV-2: Mutual relationship between the virus and the host, International Immunopharmacology, 105, (108531), (2022).

článok - https://tinyurl.com/2s3sm2jk

* https://tinyurl.com/27u67nrv

A - https://tinyurl.com/fahmabkh

B - https://tinyurl.com/479vph7w

C - https://tinyurl.com/3ucn5dzz Prvá referencia o proteínoch spojených s amyloidózou. Táto kniha ako prvá prináša systematický prehľad všetkých známych proteínov tvoriacich fibrily vrátane ich biochemických vlastností a patofyziológie. Uvažuje o klinicky rozpoznaných amyloidných proteínoch, o ktorých je známe, že sú spojené s poruchami skladania amyloidných proteínov, pričom sa zaoberá ich spoločnými štrukturálnymi a termo-dynamickými vlastnosťami, ktoré vedú k tvorbe amyloidných fibríl a ochoreniu. Dôraz sa kladie na termodynamiku skladania proteínov, štruktúru a fyziologické účinky spoločných oligomérnych a subfibrilárnych medziproduktov a vplyv extracelulárnej matrice a bunkového obchodu a metabolizmu na genézu a katabolizmus proteínov beta-skladaných listov.